Le CHYN se compose de plusieurs laboratoires de recherche qui couvrent les sujets clés en hydrogéologie et géothermie. De nombreux projets sont menés en collaboration étroite entre les laboratoires de recherche. La recherche intègre des processus physiques, chimiques, microbiologiques et mécaniques. Des innovations spécifiques sont réalisées en matière de modélisation mathématique, de méthodes d'investigations de terrain et d'appareils de mesure.